发生率较低，在大规模临床研究中，不良反应发生率低于10 %，较其它药物低。干咳最常见，发生率1～30 %、常在用药早期（几天至几周），也可能有蓄积作用。最严重而罕见的副作用为血管神经性水肿。这两种副作用各种 ACEI 都可发生，故认为与缓激肽有关。因为 ACEI 无中枢及植物神经效应，而且交感神经活性亦无影响，因此，ACEI对生活质量无不良影响。实际上，有报道治疗的患者可改善生活质量。

美国疾病控制和预防中心Hoimberg等报告，使用蛋白酶抑制剂可增加HⅣ－1 感染者的心肌梗死发病危险，尽管发生率并不高。蛋白酶抑制剂治疗HⅣ－1感染有效，但可增加高脂血症和高血糖危险，并可导致胰岛素抵抗。因此，有人担心，长期应用蛋白酶抑制剂会增加心肌梗死、心绞痛和脑血管意外发病危险。Hoimberg等在1993年1月至2002年1月期间对美国8个城市9个HⅣ诊所的5672例HⅣ－1感染患者进行了长期观察（17712．4人年）。病人平均年龄为42．6岁，其中男性占82%。Lancet 2002?360?1747　 结果显示，1996年开始应用蛋白酶抑制剂，数年后心肌梗死发病率有所增高（趋势检验，P=0．0125）。在3247例应用蛋白酶抑制剂的患者中，发生心肌梗死19例（1．42/1000人年），而在2425例未用蛋白酶抑制剂的患者中，只发生2例（0．046/1000人年）?比值比为7．1，95%CI为1．6～44．3；Cox比例危险模型—校正后危险率比为6．5，95%CI为0．9～47．8　。使用蛋白酶抑制剂种类对心肌梗死发病率无显著影响。共发生15例心绞痛，其中11例用蛋白酶抑制剂（比值比为1．93，95%CI为1．63～5．95）。发生脑血管意外14例，每组7例。研究者认为，蛋白酶抑制剂可增加心肌梗死发病危险，但心肌梗死发病率并不高，并且通常发生在有其他心血管病危险因素的患者中，不要因此而给HⅣ－1感染患者停用蛋白酶抑制剂。及早戒烟、诊断和治疗高脂血症、改善胰岛素抵抗和降压治疗都可减少蛋白酶抑制剂的这一并发症。

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